סעיף 2 לחוק גנים בוטניים, התשס״ו–2006, הכרה בגן בוטני.

(א)השר רשאי, לבקשת גן בוטני ולאחר התייעצות עם המועצה, להכיר בגן בוטני לענין חוק זה, אם נתקיימו לגביו כל אלה:

(1)בגן הבוטני קיימים 3,000 מיני צמחים שונים לפחות;

(2)הצמחים מסומנים בשמם המדעי;

(3)המידע אודות הצמחים מתועד במאגר מידע;

(4)הגן הבוטני מיועד לאחת או יותר מהמטרות האלה:

(א)שימור מיני צמחים ייחודים;

(ב)אקלום צמחים;

(ג)הוראה ומחקר בתחום הבוטניקה, האקולוגיה או החקלאות;

(ד)מטרה אחרת שקבע השר בצו, לאחר התייעצות עם המועצה, ובאישור ועדת הכלכלה של הכנסת;

(5)הגן הבוטני הוא מוסד ללא כוונת רווח, כהגדרתו בחוק מס ערך מוסף, התשל״ו–1975, והושקעו בו כספים ממקורות עצמיים, או שיש לו הכנסות עצמיות, בהיקף שקבע השר;

(6)אושרה תכנית המייעדת את שטח הגן הבוטני לשטח פתוח, בהתאם להוראות לפי חוק התכנון והבניה, התשכ״ה–1965.

השר הכיר בגנים הבוטניים הבאים: ”הגן הבוטני של האוניברסיטה העברית בהר הצופים ע״ש מונטגיו למפורט“, בהר הצופים בירושלים, המנוהל על ידי אוניברסיטת ירושלים (י״פ תשס״ט, 60); ”גנים בוטניים אוניברסיטת תל אביב“, ברמת אביב בתל אביב, המנוהל על ידי אוניברסיטת תל אביב (י״פ תשס״ט, 60); ”גן בוטני אורנים – המכללה האקדמית לחינוך“, בקרית טבעון, המנוהל על ידי עמותת אורנים – המכללה האקדמית לחינוך התנועה הקיבוצית, שמספרה – 58-000397-8 (י״פ תשס״ט, 60); ”גן וואהל לוורדים בירושלים“, בקרית הלאום בירושלים, המנוהל על ידי עיריית ירושלים (י״פ תשס״ט, 60); ”הגן הבוטני האוניברסיטאי ירושלים“, בגבעת רם בירושלים, המנוהל על ידי עמותת הגן הבוטני האוניברסיטאי, שמספרה 58-003816-4 (י״פ תשס״ט, 60); הגן הבוטני במקוה ישראל", בבית הספר החקלאי מקוה ישראל בחולון, המנוהל על ידי חברת מקוה ישראל, כל ישראל חברים, שמספרה 51-015181-4 (י״פ תשס״ט, 60); ”נקודה ירוקה – גן בוטני אקולוגי קיבוץ ניר עוז“, בקיבוץ ניר עוז המנוהל על ידי עמותת הגן הבוטני אקולוגי קיבוץ ניר עוז שמספרה 5-805049-59 (י״פ תשס״ט, 5444); ”הגן הבוטני חוות הנוי“, במועצה האזורית עמק חפר, המנוהל על ידי ארגון לגננות ולנוף בישראל, חברה פרטית שמספרה 5-700121-79 (י״פ תשס״ט, 5444); ”נאות קדומים“, השמורה הלאומית של טבע הארץ במקורות ישראל על שם נגה הראובני, ח״פ 510441389, חברה לתועלת הציבור שמספרה חל״צ/300 הרשומה ברשם ההקדשות (י״פ תש״ע, 3905); ”הגן האקולוגי בטכניון“, השייך לטכניון (מכון טכנולוגי לישראל) – מוסד ללא כוונת רווח, שמספרו: 910000173 (י״פ תש״ע, 3905); הגן הבוטני ”אילנות“ המנוהל על ידי הקרן הקיימת לישראל (י״פ תשע״ד, 6672); הגן הבוטני בסמר שמנוהל על ידי העמותה ”מתנ״ס חבל אילות“, ע״ר 58-034444-8 (י״פ תשפ״ה, 13469).

ראו גם ”גנים בוטניים בישראל“, באתר משרד החקלאות.

(ב)השר, באישור המועצה, רשאי להכיר בגן בוטני לענין חוק זה, אף אם לא נתמלא לגביו התנאי האמור בסעיף קטן (א)(1), אם יש לדעתו טעמים המצדיקים זאת.

(ג)השר רשאי, לאחר התייעצות עם המועצה ובאישור ועדת הכלכלה של הכנסת, לקבוע כללים ותנאים נוספים להכרה בגן בוטני לענין חוק זה.