סעיף 77 לתקנות השיפוט הצבאי (בתי סוהר צבאיים), התשמ״ז–1987, חובות מיוחדות של המפקד.

(א)המפקד אחראי לבריאות הכלואים, ועליו למלא, ככל האפשר, אחר הוראותיהם של קצין הרפואה הראשי ושל קצין הרפואה.

(ב)בנוסף לחובותיו האחרות כממונה על בית הסוהר חייב המפקד –

(1)לקבוע, מדי ערב, בפקודות השגרה, את סדר יומו של בית הסוהר למחרתו;

(2)לבדוק אישית, פעמיים בשבוע לפחות, את המזון הניתן לכלואים, כמותו ואיכותו;

(3)לבדוק, לפחות אחת לכל 24 שעות, את מגורי הכלואים ומיתקני השירותים ולרשום פרטי הביקור ביומן המפקד;

(4)לוודא ניהול היומנים והפנקסים שנקבעו בתקנות אלה ובפקודות הצבא;

(5)לערוך, בלווית עוזריו, לפחות פעמיים בכל שבוע, ביקורת פתע בבית הסוהר, הן בשעות היום והן בשעות הלילה, ולרשום את פרטי הביקור ביומן המפקד;

(6)לערוך מדי שבוע בשבוע סיור ביקורת תברואי בלווית קצין הרפואה ולטפל בהסרת הליקויים שנתגלו.