סעיף 3 לתקנות צער בעלי חיים (הגנה על בעלי חיים) (קרן למען בעלי חיים), התשנ״ה–1995, סמכויות ההנהלה.

ההנהלה תהיה מוסמכת לפעול לקידום מטרות הקרן כמפורט בסעיף 14(ב) לחוק, ובכלל זה תהיה ההנהלה מוסמכת –

(1)להכין ולהציע תכנית רב שנתית של הקרן, וכן תכנית פעולה שנתית שתוגש לא יאוחר מ־31 בדצמבר של כל שנה; כמו כן להכין הצעת תקציב והצעת תקציב פיתוח; הקרן תתוקצב במסגרת תקציב המדינה; הצעות ההנהלה טעונות אישור השר;

(2)לאשר את ביצוע הפעולות הדרושות למימוש מטרות הקרן ותפעולה, לרבות השקעות ורכישות במסגרת תקציביה המאושרים;

(3)ליזום קבלת ייעוץ, סקרים ודוחו״ת מומחים, בכל הדרוש לקידום מטרות הקרן;

(4)לאשר קבלת כספים והקצבות לקרן ולהקציב כספים מתוך קופת הקרן לשם ביצוע סמכויותיה.