Section 1ב of צו איגוד ערים לאיכות הסביבה (אזור אגן בית נטופה), התשנ״ו–1996, תפקידי האיגוד.

תפקידי האיגוד הם לפעול ככל הדרוש לשמירה על איכות הסביבה ולמניעת מפגעים סביבתיים בתחום האיגוד, ובין היתר, יעסוק האיגוד בתחומי פעילות כמפורט להלן:

(1)ייעוץ סביבתי לרשויות המקומיות, ולמחלקות השונות ברשות העוסקות בנושאים סביבתיים כגון מחלקות רישוי עסקים, ולועדות התכנון והבניה המקומיות;

(2)תיאום פעילות סביבתית עם גורמי חוץ, ובכלל זה משרדי ממשלה, רשויות מקומיות, גופים ומוסדות כגון קק״ל ורשות שמורות הטבע, וכן ארגונים אחרים שעיסוקם בתחום איכות הסביבה;

(3)ייעוץ ופיקוח בנושא הטיפול בפסולת מוצקה וסילוקה;

(4)ייעוץ ופיקוח בנושא הטיפול בביוב והשימוש בקולחים;

(5)טיפול, ייעוץ ופיקוח בכל הקשור לחומרים מסוכנים ולפסולת מסוכנת וסילוקה;

(6)ניטור ופיקוח על תעשיות ובקרת אזורי תעשיה;

(7)ייעוץ, פיקוח וטיפול במפגעי רעש;

(8)ייעוץ, פיקוח וטיפול במפגעי זיהום אויר;

(9)ייעוץ, פיקוח וטיפול בזיהומים חקלאיים;

(10)קידום החינוך הסביבתי;

(11)הכנת דו״ח שנתי על מצב איכות הסביבה ברשויות;

(12)הקמת מסד נתונים סביבתיים באזור.